Glifosat ve parakuat arasındaki temel fark etki ve uygulama şekillerinde yatmaktadır:

Aksiyon modu:

Glifosat: Esansiyel amino asitlerin sentezinde yer alan bir enzimi inhibe ederek çalışır, böylece bitkilerde protein üretimini bozar.Bu eylem sistemik etkilere yol açarak bitkilerin içten dışa doğru solmasına ve ölmesine neden olur.

Paraquat: Seçici olmayan bir temaslı herbisit görevi görür ve temas halinde yeşil bitki dokusunun hızla kurumasına ve ölümüne neden olur.Paraquat, kloroplastlarda toksik serbest radikaller üreterek fotosentezi bozar, doku hasarına ve bitki ölümüne yol açar.

Seçicilik:

Glifosat: Hem otlar hem de geniş yapraklı yabani otlar olmak üzere çok çeşitli bitkileri öldüren sistemik bir herbisittir.Tarımda, peyzajda ve mahsul dışı alanlarda sıklıkla kullanılır.
Paraquat: Temas halinde yeşil bitki dokularının çoğunu öldüren, seçici olmayan bir herbisittir.Öncelikle sanayi bölgelerindeki yabani otlarda, yol kenarlarında ve tarım dışı ortamlarda olduğu gibi mahsul olmayan alanlarda kullanılır.

Toksisite:

Glifosat: Etiket talimatlarına göre kullanıldığında insanlar ve hayvanlar için düşük toksisiteye sahip olduğu düşünülmektedir.Ancak potansiyel ekolojik ve sağlık etkilerine ilişkin tartışmalar ve araştırmalar devam etmektedir.
Paraquat: İnsanlar ve hayvanlar için oldukça zehirlidir ve yutulması veya deri yoluyla emilmesi halinde ciddi zehirlenmelere neden olabilir.Yüksek toksisitesi nedeniyle paraquat sıkı düzenlemelere ve kullanım önlemlerine tabidir.

Kalıcılık:

Glifosat: Toprak tipi, sıcaklık ve mikrobiyal aktivite gibi faktörlere bağlı olarak genellikle çevrede nispeten hızlı bir şekilde bozunur.
Paraquat: Çevrede glifosata göre daha az kalıcıdır ancak yine de belirli koşullar altında toprakta ve suda kalarak hedef olmayan organizmalar için potansiyel risk oluşturabilir.

Özetle, hem glifosat hem de parakuat yaygın olarak kullanılan herbisitler olmasına rağmen etki modları, seçicilikleri, toksisiteleri ve kalıcılıkları bakımından farklılık gösterirler ve bu da onları farklı uygulamalar ve yönetim stratejileri için uygun kılar.